مرکز ملی نوآوری و فناوری با محوریت سلامت ورزشی بر مبنای فناوری‌های نوین ترکیبی دارای یک ساختار منسجم و چند لایه است که شامل موارد زیر می‌باشد:

 الف) شورای مدیریت استراتژیک

-  متشکل از اعضای هیئت علمی برجسته دانشگاه، متخصصان صنعت و مشاوران فناوری

-  وظیفه: تعیین راهبردهای بلندمدت، ارزیابی پروژه‌ها و اطمینان از هماهنگی بین بخش‌های مختلف پروژه ها

 ب) بخش‌های تحقیقاتی و آزمایشگاهی

- آزمایشگاه هوش مصنوعی در سلامت

- آزمایشگاه بیومکانیک و رباتیک پزشکی

- مرکز داده‌ کاوی

- بخش نوآوری و کاربردی

-  واحد همکاری‌های بین‌رشته‌ای

- واحد آموزش و توسعه